植物非靶向代谢组学
植物非靶向代谢组学背景
植物是地球上最常见的生命形态之一,广泛分布于各类生境中,包括全世界水圈的大部,岩石圈的表面,大气层的底部,随着不同气候区而有不同的种类和数量。甚至在沙漠、高原、极地等极端环境下也有植物的身影。
植物中的绿藻可与真菌共生形成地衣,并共同在一些极端环境下生存。地球陆地面积的6%被地衣覆盖,北极地区的地衣是北极驯鹿的主要食物,某些地衣甚至可以抵挡高强度的宇宙射线与紫外线,在人造卫星上的研究站存活。
据估计,植物界现存大约有450000个物种,根据邱园的统计,直至2017年,在维管植物中,381910个物种已被描述和命名,其中369000种被子植物,1110种裸子植物,1300种石松类植物,10500种链束植物(狭义蕨类植物)。
与此同时,也不断有新的物种被发现,如在2016年,有1730种新发现的有胚植物被命名。
华怡创生可根据您的需求提供专业的植物非靶向组学样品前处理提取方法,以保证后续植物非靶向代谢组学的高质量数据,进而深度揭示待检测植物潜在价值。
实验步骤:
(1)植物样本前处理,如低温研磨,细胞壁破碎等;
(2)QC样本混合,确保实验条件稳定、实验结果可靠;
(3)代谢物提取,优化提取溶剂体系及提取方法;
(4)液质参数优化,包括流动相比例及洗脱梯度、柱温、流速,离子源种类及温度、扫描模式、扫描范围、二级采集模式等;
(5)代谢物鉴定,使用保留时间、准分子离子峰及二级质谱信息对比化合物标准品和多种数据库,确保高质量的化合物鉴定;
(6)统计学分析,包括单变量统计分析(t检验,倍数变化分析,火山图分析)及多元统计分析(PCA主成分分析,PLS-DA偏最小二乘判别分析,OPLS-DA正交偏最小二乘判别分析);
(7)代谢通路分析;
(8)提供分析报告,包括实验步骤,相关的液相条件及质谱参数,总离子流图,提取离子流图,平均质谱图,统计学分析结果及原始数据等。
华怡创生可提供定制化植物非靶向代谢组学服务,期待您的关注和联系。