脑脊液非靶向代谢组学
脑脊液非靶向代谢组学背景
脑脊液或脑脊髓液(英语:cerebrospinal fluid)是充满在脑部内颅骨与大脑皮质之间的蛛网膜下腔的透明体液,准确的来说是位于脑膜的蛛网膜和软脑膜之间。它是一种含有微神经胶细胞的纯生理盐水,主要用作对大脑皮质的机械性缓冲。在脑部的脑室及脊髓内亦有脑脊液存在。
脑脊液可以用作诊断包括脑和脊椎在内的中枢神经系统的疾病,例如脑膜炎、蛛网膜下腔出血、多发性硬化症等。
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实验步骤:
(1)QC样本混合,确保实验条件稳定、实验结果可靠;
(2)代谢物提取,优化提取溶剂体系及提取方法;
(3)液质参数优化,包括流动相比例及洗脱梯度、柱温、流速,离子源种类及温度、扫描模式、扫描范围、二级采集模式等;
(4)代谢物鉴定,使用保留时间、准分子离子峰及二级质谱信息对比化合物标准品和多种数据库,确保高质量的化合物鉴定;
(5)统计学分析,包括单变量统计分析(t检验,倍数变化分析,火山图分析)及多元统计分析(PCA主成分分析,PLS-DA偏最小二乘判别分析,OPLS-DA正交偏最小二乘判别分析);
(6)代谢通路分析;
(7)提供分析报告,包括实验步骤,相关的液相条件及质谱参数,总离子流图,提取离子流图,平均质谱图,统计学分析结果及原始数据等。
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