自上而下测序
自上而下测序
自上而下的蛋白质组学研究是完整的蛋白质分子离子直接引入质谱系统(ESI或MALDI)中进行气相裂解。自上而下的分析有助于直接观察序列的C端和N端,并通过不同的序列区分不同的异构体。
与传统的Edman降解相比,HIT可以提供基于MALDI ISD质谱的自上而下蛋白质组学研究,即使在序列末端被修饰(包括N端乙酰化、N端焦谷氨酸、序列截断和信号序列)阻滞的情况下,也能完成N端和C端测序服务。这种分析也可以用于表征蛋白质的降解和酶的裂解。自上而下的序列分析证实了完整蛋白的N端和C端均有20-80个残基。
在自上而下测序研究中,HIT也提供以下生物信息学服务:
1.功能注释和富集分析
2.聚类分析
3.网络分析
4.统计学分析