甲基化分析
蛋白质甲基化是一种翻译后修饰过程,通过依赖于S-腺苷甲氨酸的甲基转移酶添加甲基修饰蛋白质,以S-腺苷甲硫氨酸(SAM)作为甲基的主要供体。蛋白质的甲基化可以发生在蛋白质上的多个氨基酸上,包括精氨酸、赖氨酸、组氨酸等。甲基化是由甲基转移酶介导的,赖氨酸的甲基化涉及到在氨基酸的对胺基上加1到3个甲基,以形成单甲基赖氨酸,二甲基赖氨酸或三甲基赖氨酸。这种修饰通常发生在蛋白质上的保守序列上。根据剩余甲基附着的位置不同,有两种甲基化:N-甲基化和O-甲基化。N-甲基化是不可逆的,而O-甲基化可能是可逆的。
单碳甲基转移到氮或氧(分别为N-甲基化和O-甲基化)到氨基酸侧链,增加了蛋白质的疏水性,并能中和与羧酸结合时的负氨基酸电荷。组蛋白尾部的甲基化,结合乙酰化和磷酸化,控制它们与其他蛋白质的相互作用和基因表达的上调或下调。
HIT已经建立了一个高灵敏度的HPLC-MS/MS标准操作系统,可以分析真核生物和原核生物的N-和O-甲基化。此外,我们优化了相关实验方案,可快速、灵敏对甲基化位点进行定位服务。
HIT甲基化服务:
1.蛋白质的胶内酶解或溶液酶解
2. 针对特定甲基化序列的抗体对甲基化蛋白进行富集
3.HPLC分离,随后使用ESI-TOF MS/MS分析
4.质谱数据解析
HIT针对蛋白质翻译后修饰分析方面提供以下生物信息学服务:
1.功能注释和富集分析
2.聚类分析
3.网络分析
4.统计学分析
5.翻译后修饰的蛋白质组学分析