亚细胞蛋白质组学
细胞内编码细胞核的蛋白质分布及各细胞器的发育决定了特殊的细胞功能,因此,亚细胞结构的蛋白质组学研究是一种实用且必要的功能分析方法。这也表明,对蛋白质组学数据的正确解读需要亚细胞结构的区间信息。
亚细胞蛋白质组学降低了蛋白质组研究的复杂性。亚细胞蛋白质组学研究通常将500-4000个蛋白质划分为一组,结合凝胶和质谱,将有助于提升蛋白质分析的分辨率。相比之下,包含12000 - 40000个蛋白质的全细胞蛋白质远远超出了蛋白质组学工具的能力。基于几十年的生物化学研究,亚细胞蛋白质组学已经建立了诸多分离亚细胞结构的方法。到对密度、尺寸和电荷分离技术的修补,降低了亚细胞结构在分离时被污染的可能性。
亚细胞分离技术和基于LC-MS/MS的蛋白鉴定技术的结合,使亚细胞蛋白质组学方法用于表征亚细胞结构成为可能。从细胞和组织中提取蛋白质的成功案例表明,亚细胞预分离方法与蛋白质组分析的结合是一种有效的方法,可用于对低丰度蛋白质的检测。它揭示了包括样品制备,分析和验证等步骤在内的复杂策略研究中需要充分利用亚细胞蛋白质组学的潜力。
HIT还提供以下亚细胞蛋白质组学的生物信息学服务:
功能注释和富集分析
聚类分析
网络分析
统计学分析